2020, Vol. 44
文章信息
- 贺晓丽, 秦松, 李文军, 唐志红. 2020.
- HE Xiao-li, QIN Song, LI Wen-jun, TANG Zhi-hong. 2020.
- 海洋生物功能肽构效关系研究进展
- Research progress on structure-activity relationship of marine biological functional peptides
- 海洋科学, 44(12): 144-152
- Marina Sciences, 44(12): 144-152.
- http://dx.doi.org/10.11759/hykx20200313002
-
文章历史
- 收稿日期：2020-03-13
- 修回日期：2020-04-23
2. 中国科学院烟台海岸带研究所, 山东 烟台 264003;
3. 中国科学院海洋大科学研究中心, 山东 青岛 266071
2. Yantai Institute of Coastal Zone Research, Chinese Academy of Sciences, Yantai 264003, China;
3. Center for Ocean Mega-Science, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China
海洋生物功能肽是源自海洋生物的一类具有多种生理活性、在生物体内担负着重要调节功能的肽类化合物, 因其具有功能多样、特异性强、毒副作用小等优势, 被广泛用于多种新型食品、化妆品和药物的研发[1]。目前获得的海洋生物功能肽主要源于海洋植物(红藻、绿藻等)、海洋微生物(芽孢杆菌、链霉菌等)、侧生动物(海绵等)、脊索动物(鱼类、海鞘等)、节肢动物(虾类、蟹类、鲎等)和软体动物(牡蛎、文蛤、扇贝、鱿鱼等)[2-10]。截止到2018年, 研究人员从海洋生物中分离出30 000多种生物活性化合物, 其中功能肽2 200多种[1], 按功能可分为抗肿瘤肽、抗菌肽、抗冻肽、抗氧化肽、抗血栓肽、促钙吸收肽、免疫调节肽、血压调节肽、血脂调节肽、护肝肽等[11]。
海洋和陆地在温度、氧气含量、光照等方面存在巨大差异, 这使得海洋生物与陆地生物功能肽的结构、功能也具有较大差别。海洋生物功能肽的结构是其活性的基础, 因此探究海洋生物功能肽的构效关系, 揭示其可能的作用机理, 对于海洋生物功能肽的开发具有重要意义。近年来, 已有多篇文献介绍了海洋生物功能肽的相关研究进展, 例如Mohammad等[12]综述了从海洋生物中获得抗菌肽的研究进展, Lee等[13]综述了海洋环肽的结构与分子机制, 许旻等[14]综述了氨基酸组成对海洋生物功能肽活性的影响。这些文献多侧重于对海洋生物功能肽构效关系的某个方面进行介绍, 到目前为止, 还未见到全面系统的介绍海洋生物功能肽构效关系的文章。本文从功能肽的结构出发, 综述了多种结构因素对海洋生物功能肽活性的影响及作用机理, 为海洋生物功能肽分子机制的深入研究及相关产品的研发提供参考。
1 分子量对海洋生物功能肽活性的影响目前从海洋生物中获得的具有生理活性的功能肽分子量多为3 kDa以下, 10 kDa以上的很少(见表 1)。抗肿瘤肽一般是由3~40个氨基酸组成的小分子多肽, 从海洋生物中获得的抗肿瘤肽半数以上为1 kDa以下小分子肽, 部分在1~3 kDa之间[15-18], 但从文蛤体液中得到一种分子量为16 kDa的多肽MM-16对肿瘤细胞同样具有强烈的增殖抑制活性[9]。小分子量的抗肿瘤肽可能在生物体内更容易转运, 穿过生物膜与靶点结合; 大分子量的抗肿瘤肽可能与多糖或其他物质结合形成复杂的生物大分子从而发挥作用[19], 或受功能肽空间结构等因素的影响更大。
| 来源 | 分子量 | 生理活性 | 参考文献 |
| 文蛤体液 | 16 kDa | 抗肿瘤 | [9] |
| 菲律宾蛤 | < 3 kDa | 抗肿瘤 | [17] |
| 太平洋牡蛎 | < 3 kDa | 抗肿瘤 | [15] |
| 乌贼 | 1 371.53Da | 抗肿瘤 | [27] |
| 贻贝 | < 1 kDa | 抗肿瘤 | [18] |
| 牡蛎 | < 1 kDa | 抗肿瘤 | [7] |
| 虾蛄 | 811.80 Da | 抗肿瘤 | [28] |
| 扇贝裙边 | 1~3 kDa | 抗菌 | [10] |
| 文蛤肉 | ≤2 kDa | 抗菌 | [20] |
| 鳕鱼骨架 | ≤5 kDa | 抗氧化 | [4] |
| 长蛇鲻鱼肉 | ≤5 kDa | 抗氧化 | [22] |
| 鲭 | < 2 kDa | 抗氧化 | [23] |
| 海绵 | ≤5 kDa | 降血压 | [25] |
| 红藻 | < 3 kDa | 降血压 | [2] |
| 鱼胶原蛋白 | < 3 kDa | 降血压 | [26] |
从海洋生物中获得的抗菌肽分子量主要在3 kDa以下。杨富敏等[10]将扇贝裙边酶解液超滤分成F1 (< 1 kDa)、F2(1~3 kDa)、F3(3~5 kDa)、F4(> 5 kDa)四个组分, 实验结果表明只有F2(1~3 kDa)具有抗菌活性, 且能明显抑制大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长。姚兴存等[20]用胰蛋白酶对文蛤肉进行酶解, 发现分子量在2 kDa以下的小分子肽具有抗菌活性, 其中1.6 kDa左右的小分子肽抗菌活性最强, 能明显抑制大肠杆菌的增殖。
小分子的抗氧化肽会更有效地通过生物膜, 清除生物体内的自由基[21], 具有更高的抗氧化活性。Jeon等[4]发现鳕鱼骨架酶解产物中相对分子质量为5 kDa的抗氧化活性约是分子量为10 kDa的2倍。包斐[22]通过研究长蛇鲻鱼肉蛋白酶解产物超滤后各组分的生理活性发现相对分子量≤5 kDa的组分较 > 5 kDa的组分具有更强的抗氧化活性。然而, Wu[23]等通过研究发现鲭的酶解产物中相对分子质量为1.4 kDa的组分抗氧化活性明显强于 < 1 kDa的组分。这说明功能肽的抗氧化活性与分子量之间并非简单的线性相关, 也可能与其氨基酸的组成等因素有关。
血管紧张素转化酶(angiotensin converting enzyme, ACE)抑制肽是一类常用于治疗高血压的药物, 分子量小的肽段更容易与ACE活性部位结合, 通过干扰ACE催化底物而发挥其抑制活性[24]。Ko等[25]把从海绵水解产物中分离出的ACE抑制肽分为三个分子量范围, 其中低于5 kDa的组分ACE抑制活性最高, 纯化后的ACE抑制肽分子量在300 Da左右; Cao等[2]将红藻酶解液按分子量分为 > 10 kDa、3~10 kDa和 < 3 kDa的三个组分, 结果表明 < 3 kDa的组分ACE抑制活性最高, 为78.15%±1.56% (2.0 mg/mL)。汪雨亭等[26]也发现鱼胶原蛋白酶解产物中分子量 < 3 kDa的海洋胶原多肽CP-ⅠACE抑制活性远高于分子量 > 3 kDa的海洋胶原多肽CP-Ⅱ。
2 氨基酸组成和序列对海洋生物功能肽活性的影响Tyagi等[29]提出半胱氨酸(Cys)、甘氨酸(Gly)、亮氨酸(Leu)、赖氨酸(Lys)和色氨酸(Trp)在抗肿瘤肽中具有重要作用, 除虾蛄外, 从十几种海洋生物中获得的抗肿瘤肽均至少含有上述一种或几种氨基酸, 其中Gly出现的频率最高, 其次为Leu[15-18]。除此之外, 通过对大量抗肿瘤肽氨基酸序列的对比发现大多数抗肿瘤肽含有碱性氨基酸, 这可能由于碱性氨基酸在体内解离后带正电荷, 易与带负电荷的肿瘤细胞膜结合并破坏其膜结构的完整性, 从而杀死肿瘤细胞。Umayaparvathi等[7]从牡蛎中分离纯化出一种抗肿瘤肽SCAP1, 其氨基酸序列为LANAK, 对人结肠癌(HT-29)细胞株具有抑制活性。但程林友[8]从玻璃海鞘中分离出一种氨基酸序列为MVVOPDGQSECPDGN的抗肿瘤多肽不含有碱性氨基酸, 对人肝癌细胞(BEL-7402)、人结肠癌细胞(HCT-116)和人宫颈癌细胞(HeLa)三株肿瘤细胞表现出很高的抑制活性, 作用48 h IC50分别为2.74 µmol/L、3.55 µmol/L、3.39 µmol/L。
β-防御素是一类富含Cys的抗菌肽, 广泛存在于植物、动物和真菌中[30]。从海洋生物中获得的抗菌肽中大多符合β-防御素的特点, 富含Cys并形成分子内二硫键以维持抗菌肽空间结构的稳定性, 保证其不会受到从溶液环境到细胞膜环境变化的影响[14]。孙敬敬等[31]从厚壳贻贝中提取出一种含有由6个Cys形成3对二硫键的抗菌肽Mytichitin-A, 对真菌、革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌均具有抑制作用; Ruangsri等[32]也从大西洋鳕鱼中鉴定出一种具有6个保守Cys残基的防御素抗菌肽, 对桔小球菌和黄褐微球菌有明显的抑制作用。
研究表明疏水性氨基酸在抗氧化肽序列中出现的频率较高, 这类氨基酸能够通过延缓脂质的过氧化反应起到抗氧化作用[33], 从海洋生物中获得的抗氧化肽也符合该规律。Umayaparvathi等[7]从牡蛎中分离纯化出三种抗氧化肽LANAK、PSLVGRPVGKLTL和VKVLLEHPVL均含有疏水性氨基酸, 对·DPPH自由基具有较强的清除能力。姚翔等[34]从低值紫菜酶解液中分离纯化出一种含有疏水性氨基酸Val的抗氧化肽—ELAP, 其氨基酸序列为DGVGYG。包斐[22]从长蛇鲻鱼肉提取出的抗氧化肽也富含脯氨酸(Pro)、甲硫氨酸(Met)、缬氨酸(Val)、苯丙氨酸(Phe)、异亮氨酸(Ile)、Leu、Trp等疏水性氨基酸。
体细胞ACE的3个催化位点均具有明显的疏水性, 所以功能肽中疏水性氨基酸的含量在一定程度上决定了其ACE抑制活性的高低[35]。目前从多种生物中提取的降压肽均含有疏水性氨基酸: Chizuru等[36]从珍珠牡蛎壳蛋白酶解液中分离出一种-N末端为疏水性氨基酸的降压肽, 其氨基酸序列为GVGSPY; Cao等[2]也从海洋红藻中分离出一种-N末端为疏水性氨基酸的降压肽, 其氨基酸序列为QVEY, IC50值为474.36 μmol/L; Lee等[37]从大马哈鱼鱼皮酶解液中得到一种降压六肽—GLPLNP, 其中疏水性氨基酸占比30%以上。
3 空间结构对海洋生物功能肽活性的影响抗肿瘤肽的空间结构会影响其分子机制。Teta等[38]从海绵中提取出一种含有多吡咯烷酮单元的混合肽/聚酮化合物Smenamides A和B, 两种化合物的区别在于C-13的双键构型。研究发现二者抗肿瘤的分子机制不同可能取决于它们位于分子中心附近的C-13/C-15双键结构, 用不同类型的肿瘤细胞(如乳腺癌、卵巢癌和黑色素瘤细胞)对Smenamides生物活性进行初步检查均得出类似的结果。
从多种海洋生物中提取的抗菌肽含有α-螺旋或β-折叠结构。α-螺旋结构区域一般具有较高的两亲性, 有利于抗菌肽与细菌生物膜的结合; β-折叠能维持抗菌肽空间结构的稳定性, 使其避免受环境影响[14]。Zhu等[39]通过特定的氨基酸替换来改变抗菌肽的螺旋度, 发现其抗菌活性随螺旋度的降低而降低。
无规则卷曲对提高抗氧化肽的活性具有重要作用。Ma等[40]对从珠母贝中获得的多条抗氧化肽进行定点突变、分子修饰并在体外合成, 利用生物信息学技术和同源建模方法对其进行分析并研究抗氧化肽结构与活性之间的关系, 结果表明PFMAP、NPFMAP等多条肽段会产生具有抗氧化活性的无规则卷曲。与肽链长度、氨基酸组成、一级结构、侧链糖基化程度、侧链结构以及分子量大小相比, 这种无规则卷曲的空间构象在肽的抗氧化活性中可能起着更重要的作用。利用SWISS-MODEL建立NPFMAP空间构象的三维结构模型, 模拟结果表明这些无规则卷曲可以暴露更多的活性位点, 使NPMFAP中的氨基酸表现出更高的抗氧化活性。除此之外, β-折叠也能增加抗氧化肽的活性和稳定性。
研究表明, β-折叠能提高降压肽的稳定性。柯丽娟[41]通过超滤对鲍鱼内脏胶原降压肽进行初步分离, 用红外光谱分析发现超滤前后多肽的结构差别主要出现在指纹区, 经过DEAE-52纤维素阴离子交换层析后的多肽二级结构中只发现β-折叠结构, 可初步认为β-折叠结构对鲍鱼内脏胶原降压肽的稳定性具有一定的作用。
4 其他因素对海洋生物功能肽活性的影响 4.1 氨基酸构型近年来的研究表明氨基酸的构型会影响某些功能肽的活性。Zhao等[42]通过制备两种新的异吲哚phakellistantin 2环肽类似物发现含有D-Pro残基的化合物对人肝癌细胞(HepG2)的抗肿瘤活性比含有L-Pro残基的化合物强, 说明氨基酸的构型会影响抗肿瘤肽的生物活性。海洋环肽Galaxamide对人肺癌细胞(A549)、人宫颈癌细胞(HeLa)的IC50分别为8.98 µg/mL、6.48 µg/mL, 陈萌等[43]利用D-型氨基酸取代和甲基化修饰分别得到两个Galaxamide类似物a7和b1, a7对A549、HeLa的IC50分别为7.04 µg/mL、5.85 µg/mL, b1对A549、HeLa的IC50分别为7.39 µg/mL、8.00 µg/mL。这一结果表明与甲基化相比, 氨基酸的构型对提高Galaxamide的抗肿瘤活性影响更大。这可能是由于体内代谢氨基酸的酶, 绝大多数均只能作用于L-型氨基酸, 而不能作用于D-型氨基酸, 所以含D-型氨基酸的功能肽在体内往往具有更强的稳定性。但氨基酸构型并非是影响功能肽抗肿瘤活性的必要因素。Luesch等[44]从海洋蓝藻中分离出一种环酯肽类化合物-apratoxin A, 其氨基酸残基均为L-型, 在体外实验中表现出较强的抗肿瘤活性, 对人口腔表皮癌KB细胞和人结肠癌LoVo细胞的IC50值分别为0.52 nmol/L和0.36 nmol/L。
Chen等[45]发现大豆抗氧化肽的构型与活性之间存在相关性, 将抗氧化肽LLPH中的L-型组氨酸(L-His)替换为D-His后, 该肽的抗氧化活性明显下降。但在海洋生物功能肽构效关系的研究中, 氨基酸构型对功能肽活性影响的研究较少, 主要集中在海洋生物功能肽绝对构型和生物活性的测定[46, 47]。
4.2 环肽能否穿透生物膜以及在生物体内的稳定性是限制多肽类药物应用的主要因素[48]。环肽是一类含有环结构的多肽链, 研究表明它们具有良好的稳定性、对外肽酶和内肽酶水解较高的抵抗性以及对靶分子的结合性和选择性[49]。李晓晖等[50]研究发现带正电荷的环肽可以通过增加细胞膜表面的粗糙程度增加磷脂双分子层的流动性, 从而提高细胞的内吞作用来促进跨膜转运。Biron等[51]研究发现N-甲基化可以通过增加环肽分子的脂溶性来增加细胞膜的穿透性。
近年来从海洋生物中获得的部分环状肽见表 2, 它们主要来源于海绵、藻类和海洋微生物。这些环状肽具有多种结构形式, 例如环状寡肽、环状糖肽、环状脂肽和环状缩肽等, 并且表现出广泛、有效的药理活性, 包括抗肿瘤、抗菌、抗炎、抗肥胖和细胞毒性等。这些环状肽的结构对其活性和作用方式有着重要影响, Zhao等[42]从海绵中获得的环状寡肽Phakellistatin 2能够通过膜破裂机制杀死肿瘤细胞; Routhu等[6]从芽孢杆菌AKLSR1中提取的环状脂肽CLPs能够诱导肺癌细胞A549的凋亡; Pangestuti等[52]从海绵中获得的环状糖肽DiscoderminsA-H可以通过改变生物膜的通透性抑制细菌的生长。海洋生物环状肽在药物开发方面也表现出很好的前景, 例如普利提环肽(Plitidepsin)在治疗骨髓瘤的Ⅲ期临床研究中表现出良好的疗效和安全性[53], 艾莉丝环肽(Elisidepsin)也进入转移性或晚期胃食管癌治疗的Ⅱ期临床研究[54]。
| 环肽 | 类型 | 来源 | 生理活性 | 作用机理/对象 | 参考文献 |
| Phakellistatin 2 | 环状寡肽 | 海绵 | 抗肿瘤 | 通过膜破裂机制杀死肿瘤细胞 | [42] |
| Galaxamide | 环状同五肽 | 丝状藻 | 抗肿瘤 | 线性亮氨酸二肽可以通过抑制细胞周期和诱导细胞凋亡来抑制肿瘤细胞的增殖 | [55] |
| Apratoxin A | 环状脂肽 | 蓝藻 | 抗肿瘤 | 对多种人肿瘤细胞具有细胞毒作用 | [44] |
| CLPs | 环状脂肽 | 芽孢杆菌AKLSR1 | 抗肿瘤 | 诱导肺癌细胞A549凋亡 | [6] |
| Trikoramide A | 环状寡肽 | 蓝藻 | 抗肿瘤 | 对人急性淋巴母细胞白血病细胞(MOLT-4)和人急性髓系白血病细胞(AML2)具有细胞毒作用 | [56] |
| Euryjanicin A | 环状寡肽 | 海绵 | 抗肿瘤 | 对人宫颈癌细胞株HeLa具有细胞毒作用 | [57] |
| DiscoderminsA-H | 环状糖肽 | 海绵 | 抗菌 | 改变生物膜的通透性 | [52] |
| Rakicidin F | 环状缩肽 | 链霉菌 | 抗菌 | 抑制细菌的生长 | [5] |
| Theonellamide A | 环状多肽 | 海绵 | 抗菌 | 有效地结合至含3β-羟基甾醇的双分子层, 破坏生物膜的完整性 | [58] |
| Hassallidins | 环状糖脂肽 | 蓝藻 | 抗菌 | 破坏细胞膜, 导致细胞溶解/坏死死亡, 外膜迅速解体, 并伴有碘化丙二钠等小分子内化到细胞内 | [3] |
| StylissatinA | 环状寡肽 | 海绵 | 抗炎、抗肥胖 | 有效抑制成熟脂肪细胞前脂肪细胞的分化, 降低甘油三酯的积累, 具有很小的细胞毒性 | [59] |
功能肽所带电荷对其抗肿瘤活性和抗菌活性有重要影响。正常哺乳动物细胞膜一般呈中性, 肿瘤细胞和细菌细胞膜表面一般呈负电性, 含正电荷的功能肽更容易与带负电荷的膜表面特异性结合, 造成其细胞膜损伤且不损伤正常组织细胞[60]。Hsu等[61]从红海鲷中得到一种阳离子抗菌肽——Chrysophsin-1, Chssophsin-1可以破坏生物膜膜中阴离子脂质成分的脂质酰基链顺序, 并且该抗菌肽羧基端的RRRH序列可以形成类似于蜂毒蛋白的非螺旋亲水结构域, 使抗菌肽具有双亲性, 能优先结合并插入带负电的细胞膜。Ahn等[62]采用氨基酸替换法使不具抗菌活性的Tenecinl螺旋区域正电荷数增加, 结果其抗菌活性也显著增加。Yang等[63]报道多肽Tritrpicin的衍生物在正电荷数大于5之后抗菌活性不再随正电荷数增加而提高, 说明抗菌肽正电荷数和抗菌活性间也并非绝对正相关性。
5 展望我国丰富的海洋生物资源为功能肽提供了充足的来源, 这些功能肽从营养品到药物有着广泛的应用, 包括抗菌、抗病毒、抗癌、降血压、降血糖和细胞毒性等多个方面。海洋活性肽药物如Ziconotide、Brentuximab Vedotin等已获食品药品监督管理局(Food and Drug Administration, FDA)批准成功进入医药市场[64]。尽管海洋生物功能肽在药理学应用方面具有巨大潜力, 但许多海洋生物活性肽由于免疫原性差、半衰期短和口服利用度低等缺陷, 还未被批准进入市场, 正处于临床应用阶段, 研究其构效关系有利于对海洋生物功能肽进行结构改造和修饰, 以延长其半衰期, 降低免疫原性, 推进新型药物的筛选和研发工作。例如, 从海洋无壳软体动物截尾海兔中获得海兔毒素10(Dolastatin 10, D10)是由4个氨基酸组成的线性缩肽类天然毒性蛋白, 由于能使40%的患者产生中度的外周神经毒性, Ⅱ期临床实验已经终止。利用其构效关系, 合成了具有高活性、低毒性的D10衍生物TZT-1027, 该化合物能在细胞分裂期干扰微管的聚合及稳定性, 目前已进入治疗软组织肉瘤的Ⅱ期临床试验阶段[65]。
本文主要综述了几种结构因素(如分子量的大小、氨基酸的构型及排列顺序、功能肽的空间结构等)对海洋生物功能肽活性的影响, 但主要集中在抗肿瘤肽、抗菌肽、抗氧化肽和降压肽, 对其他功能肽的构效关系仍需进一步研究。随着技术和设备的进步, 未来不仅有望发现更多的海洋生物功能肽, 并且对功能肽构效关系的研究也会进一步深入。明确海洋生物功能肽的构效关系, 可以结合现代基因工程和发酵工程技术, 获得更符合市场需求的目标产物, 实现海洋生物功能肽的高效和规模化生产, 从而创造更多的经济效益。
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