文章信息
- 吴琦汉, 滕爽爽, 李敏, 张翔, 肖国强, 张建设, 陈丽芝. 2025.
- WU Qihan, TENG Shuangshuang, LI Min, ZHANG Xiang, XIAO Guoqiang, ZHANG Jianshe, CHEN Lizhi. 2025.
- 泥蚶哈维氏弧菌抗性性状遗传参数的估计
- Estimation of genetic parameters of the resistance traits of Tegillarca granosa to Vibrio harveyi
- 海洋科学, 49(3): 107-115
- Marine Sciences, 49(3): 107-115.
- http://dx.doi.org/10.11759/hykx20241210004
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文章历史
- 收稿日期:2024-12-10
- 修回日期:2025-02-19
2. 浙江省海洋水产养殖研究所, 全省近岸生物种质资源保护与利用重点实验室, 浙江-泰国海洋技术联合实验室, 温州市海洋生物遗传育种重点实验室, 浙江 温州 325000;
3. 三门县水产技术推广站, 浙江 三门 317100
2. Zhejiang Mariculture Research Institute, Zhejiang Key Laboratory of Coastal Biological Germplasm Resources Conservation and Utilization, Sino-Thai Joint Laboratory of Marine Technology, Wenzhou Key Laboratory of Marine Biological Genetics and Breeding, Wenzhou 325000, China;
3. Extension Station for Aquaculture Technique, Sanmen 317100, China
泥蚶(Tegillarca granosa)属软体动物门(Mollusca)、双壳纲(Bivalvia)、列齿目(Taxodonta)、蚶科(Arcidae)、泥蚶属(Tegillarca), 是一种栖息于沿海滩涂的广温性软体动物, 东南亚和东亚等地区均有分布, 在中国主要分布在浙江、福建、广东等地。近年来, 随着贝类养殖业的迅速发展, 养殖规模不断扩大, 养殖苗种种质退化、养殖环境污染等多种因素导致的细菌性疾病, 损害了海洋贝类的生长发育和经济效益, 其中由贝类弧菌病所造成的经济损失占据重要部分[1]。泥蚶作为中国沿海滩涂的主要养殖贝类之一, 在每年的7-8月间会遭受到弧菌的侵袭, 泥蚶养殖和经济效益受到严重影响。2014年浙江滩涂暴发泥蚶大规模死亡, 滕爽爽等[2]从发病死亡的泥蚶中分离出1株优势菌, 经鉴定为哈维氏弧菌(Vibrio harveyi) J14菌株, 确定在夏季时, 哈维氏弧菌是引起泥蚶大规模死亡的主要病原菌。哈维氏弧菌是许多海水养殖生物的致病菌之一, 该弧菌已报道可在中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)[3]、长牡蛎(Crassostrea gigas)[4]、珠母贝(Pinctada margaritifera)[5]、点带石斑鱼(Epinephelus coioides)[6]等多个海洋生物中引起疾病。为了减少细菌性疾病带来的经济损失, 提高泥蚶的抗病能力、筛选出抗病性强的个体进行遗传改良是行之有效的方法。
遗传选育是选择优良抗病品种的重要手段, 对抗病性状遗传参数的估算和遗传力的分析是选育工作中十分重要的内容。遗传参数估计是水产动物遗传改良的一项基本工作, 在育种值评估和育种规划的选择方面, 遗传力和遗传相关都能提供重要的参考[7-8]。卢昇等[9]通过两次半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)感染实验, 通过线性和阈值模型估算抗哈维氏弧菌的遗传力和育种值大小, 结果表明抗性性状具有中低遗传力水平, 适合家系选育。梁冰冰等[10]构建文蛤(Meretrix meretrix)家系进行副溶血弧菌的人工感染实验, 采用3种不同的模型对抗性性状进行遗传参数评估, 分析得出弧菌抗性性状遗传力属于中等遗传力性状, 其生长与抗性性状之间没有检测到显著的遗传相关。郑卫卫等[11]采用logit模型计算牙鲆(Paralichthy soliyaceus) 抗迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)的遗传力, 为低遗传力, 筛选出抗迟缓爱德华氏菌强的家系, 并指出牙鲆的抗病性状通过家系选育的方法是有效的。目前对泥蚶遗传育种主要集中在生长等经济性状的遗传改良[12-13], 关于泥蚶抗哈维氏弧菌遗传参数的相关报道较少。
本研究通过线性动物模型(截面线性和时间线性模型)和logit阈值模型评估了泥蚶家系生长与抗性性状的遗传参数, 并利用ASRreml 4.2软件估算遗传力、育种值、遗传相关和表型相关, 以期筛选出抗病性强的家系, 为泥蚶高品质品系的选育提供基础数据和资料, 为泥蚶养殖业的可持续发展提供支持。
1 材料与方法 1.1 实验材料本研究中使用的泥蚶亲本来源于“乐清湾1号”(GS-01-006-2014), 2022年7月在浙江省海洋水产养殖研究所清江基地通过人工授精的方式, 以每1个泥蚶雄贝配子分别与3个雌贝配子混合的组合方式, 采用巢式设计的方法建立了16个半同胞家系和48个全同胞家系。养至18月龄, 共保留了22个家系(壳长(21.23±1.90) mm, 总质量(3.86±0.98) g)。将泥蚶家系从养殖塘取回, 实验前用海水冲洗泥蚶壳表污物, 用5 mg/L高锰酸钾溶液浸泡约1 min进行消毒, 再将泥蚶在2 000 L的平面流中暂养, 水温控制在28 ℃± 0.5 ℃, 持续充氧, 暂养1周。暂养期间, 每24 h换水1次, 每天早晚定时投喂角毛藻(Chaetoceras)。
感染实验选用的病原菌为哈维氏弧菌, 哈维氏弧菌的菌株为实验室前期保存的菌株。菌株于–80 ℃冰箱中长期保存, 弧菌先于固体培养基2216E上涂布活化, 在30 ℃恒温培养箱中倒置过夜培养, 用接种环取单菌落于50 mL 2216E液体培养基中, 28 ℃振荡摇床中培养12 h, 然后转移到1 L 2216E液体培养基扩大培养。取1 mL菌液于1.5 mL离心管中, 以5 000 r/min离心3 min, 使用无菌PBS缓冲溶液等体积重悬菌液2次, 并用分光光度计测定OD值(560 nm), 根据标准曲线计算弧菌浓度[14]。
1.2 实验方法从每个家系中随机选取60个泥蚶, 感染组和对照组各30个。弧菌感染前, 将感染组和对照组的泥蚶转移到两个135 L白桶中, 根据杨千元等[15]确定的感染浓度, 向感染组中倒入哈维氏弧菌, 使其终浓度达到1.5×107 CFU/mL。攻毒期间, 水温控制在28 ℃±0.5 ℃, 整个过程持续充氧, 每天换1次海水, 投喂饵料2 h后, 加入哈维氏弧菌。实验第8天泥蚶出现大量死亡, 停止攻毒, 每日更换海水, 并投喂充足饵料。实验期间, 早晚各统计1次泥蚶死亡数量, 泥蚶连续3 d未出现死亡即停止实验。
1.3 数据分析 1.3.1 遗传分析模型本研究采用两种方式评估泥蚶对哈维氏弧菌的抗性。一种通过0和1分别表示个体泥蚶在感染实验中的死亡与存活状态, 另一种记录泥蚶在实验中的存活天数。
使用3种不同的模型分析生存数据。
截面线性模型(Cross-sectional Linear Model, CLM), 将死亡/存活状态(0/1)作为表型数据进行线性分析, 定义为:
式中,
时间线性模型(Days Linear Model, DLM), 以存活时间为表型数据进行线性分析, 模型定义同模型CLM, 其中
截面阈值模型(Cross-sectional Threshold Model, CTM), 将死亡/存活状态(0/1)作为表型数据, 通过logic阈值模型进行分析, 定义为:
模型CTM中所有参数定义同模型CLM。
1.3.2 遗传力遗传力计算公式为:
式中,
生长性状与抗性性状之间的遗传相关公式为:
式中,
为了比较不同遗传评定模型对泥蚶抗性性状育种估计值准确性的预测能力, 使用Pearson和Spearman相关分析3种模型中各家系抗性育种值之间的相关性, 计算Pearson和Spearman相关系数。
1.3.5 统计分析方法本研究采用Origin 2022绘制Kaplan-Meier生存曲线, 采用SPSS 26.0软件分析各家系抗性育种值的相关性, 运用ASReml 4.2软件估算上述3种模型的遗传力、育种值、方差组分、遗传相关和表型相关及其显著性差异(P > 0.05)[16]。
2 结果与分析 2.1 感染实验结果22个泥蚶家系4个生长性状的描述性统计见表 1, 壳长、壳高和壳宽的变异系数都较低, 均在9%左右, 显示出这些性状的个体差异较小, 样本分布较为集中, 总质量的变异系数最高, 为25.39%, 说明个体之间的总质量差异较大, 可能受到其他因素的影响。感染组和对照组的累积存活率以及日死亡数情况分别如图 1和图 2所示, 图中泥蚶累计存活率和日死亡数均为所有家系的总体数据体现。感染组在第3天时泥蚶出现死亡, 泥蚶日死亡数随天数持续增加, 在第8天时泥蚶死亡数达到最高, 之后泥蚶日死亡数逐渐减少, 至第14天时不再出现死亡个体, 实验于第16天结束。对照组在实验期间正常存活, 无死亡现象, 表明感染组泥蚶的死亡由哈维氏弧菌刺激引起。
| 性状 | 数目/个 | 平均值±标准偏差 | 变异系数/% |
| 壳长/mm | 660 | 21.23±1.90 | 8.97 |
| 壳高/mm | 660 | 16.59±1.45 | 8.72 |
| 壳宽/mm | 660 | 14.00±1.31 | 9.35 |
| 总质量/g | 660 | 3.86±0.98 | 25.39 |
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| 图 1 感染组泥蚶存活率及日死亡数 Fig. 1 Survival rate and daily mortality of Tegillarca granosa in the infected group |
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| 图 2 对照组泥蚶存活率及日死亡数 Fig. 2 Survival rate and daily mortality of Tegillarca granosa in the control group |
哈维氏弧菌感染实验结束时, 感染组家系的存活率如图 3所示, 各家系存活率差异较大, 未呈现显著规律。其中, 1号、7号和16号家系的存活率最低, 仅为6.7%, 而24号家系最高, 达60%。通过实验结果分析, 存活率超过50%的5个家系被归为高抗家系, 存活率低于10%的4个家系被归为敏感家系。
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| 图 3 不同家系感染组的存活率 Fig. 3 Survival rate of the infected groups in different families |
根据3种不同模型估算的泥蚶抗哈维氏弧菌的遗传力估计值有一定的差异(表 2), 从CTM模型可以看出, 随着攻毒时间的增加, 存活率降低, 遗传力估计值呈现升高的趋势, 当存活率趋于稳定时, 遗传力估计值维持在0.18±0.05, 加性效应也趋于0.70±0.26。使用DLM模型时, 遗传力估计值高于前两种模型, 为0.20±0.07, 加性效应远大于前两种模型, 为3.43±1.38。总体来说, 3种模型的遗传力估计值差距不大, 都属于中低等遗传力水平, 意味着泥蚶抗哈维氏弧菌有一定的遗传性。
| 模型 | 天数/d | 存活率/% | 遗传力估计值 | 加性遗传方差 |
| CTM | 4 | 94.70 | 0.03±0.12 | 0.11±0.41 |
| 6 | 78.48 | 0.06±0.04 | 0.21±0.17 | |
| 8 | 54.55 | 0.11±0.04 | 0.41±0.18 | |
| 10 | 31.67 | 0.17±0.05 | 0.70±0.26 | |
| 12 | 29.39 | 0.18±0.05 | 0.72±0.27 | |
| 16 | 28.94 | 0.18±0.05 | 0.70±0.26 | |
| CLM | 16 | 28.94 | 0.19±0.07 | 0.04±0.02 |
| DLM | 16 | 28.94 | 0.20±0.07 | 3.43±1.38 |
| 注: |
||||
利用3种模型估算各家系的育种值, 并计算其Pearson和Spearman相关系数(表 3), 结果显示3种模型之间均呈极显著的正相关, 其中模型CTM与模型CLM之间的相关系数最高, 均为0.998, Pearson和Spearman相关系数范围分别为0.978~0.998和0.953~0.998, 结果表明, 3种模型在泥蚶抗性性状育种值的估计能力基本一致。
| 模型 | CTM | CLM | DLM |
| CTM | 0.998** | 0.978** | |
| CLM | 0.998** | 0.981** | |
| DLM | 0.953** | 0.958** | |
| 注: 上三角: Pearson相关分析; 下三角: Spearman相关分析; **: 极显著相关(P<0.01) | |||
生长性状与抗性性状之间的遗传相关和表型相关分析结果表明(表 4), 3种模型分析的抗性性状与4个生长性状之间的遗传相关均为不显著的负相关(P > 0.05), 抗性性状与4个生长性状之间的表型相关均为不显著的负相关(P>0.05), 针对单个生长或抗弧菌性状的选育可能对另一个性状不造成显著影响。
| 相关性 | 模型 | 壳长 | 壳高 | 壳宽 | 质量 |
| rG | CTM | –0.463±0.264 | –0.412±0.289 | –0.441±0.290 | –0.541±0.247 |
| CLM | –0.450±0.227 | –0.484±0.226 | –0.502±0.227 | –0.528±0.212 | |
| DLM | –0.465±0.223 | –0.494±0.222 | –0.470±0.232 | –0.545±0.207 | |
| rp | CTM | –0.111±0.054 | –0.088±0.043 | –0.076±0.040 | –0.105±0.052 |
| CLM | –0.107±0.048 | –0.105±0.047 | –0.082±0.047 | –0.089±0.049 | |
| DLM | –0.099±0.049 | –0.094±0.048 | –0.069±0.047 | –0.091±0.050 | |
| 注: |
|||||
浸泡感染和注射胁迫是常用于水产动物研究和疾病模型构建的两种方式, 浸泡感染能模拟泥蚶在自然条件下的弧菌感染过程, 避免了因操作导致的额外应激效应[17-18], 注射胁迫对操作技术要求较高, 操作不当会对泥蚶造成机械损伤[19], 并且注射胁迫不是一种自然的感染机制。黄姑鱼(Nibea albiflora)[20]、文蛤[21]、半滑舌鳎[22]等这些品种的抗病选育都是通过浸泡感染的方式, 利用遗传评定模型对实验数据进行分析, 估算出对应抗性性状的遗传力和遗传相关。本研究采用浸泡感染的方式对泥蚶进行哈维氏弧菌的感染实验, 感染组泥蚶在实验期间内死亡率达到71.06%, 对照组没有出现泥蚶死亡的现象, 说明泥蚶死亡受哈维氏弧菌刺激影响较大, 受环境因素影响较小。
3.2 生长与抗性性状的遗传参数为了更好地了解泥蚶抗哈维氏弧菌的遗传参数, 本研究采用两种性状定义拟合的3种遗传评定模型进行分析。结果分析得出, 模型DLM和CTM分析得到的最大和最小的遗传力分别为0.20和0.18, 模型CLM估算的遗传力0.19介于两者之间, 均属于中低遗传力水平。3种模型估算的育种值之间的相关系数都很高, 均达到了0.95以上, 呈高强度正相关关系, 表明使用同种表型定义时, 线性或阈值模型对相关系数排名影响很小[23], 与BANGERA等[24]报道的相关系数(>0.90)基本一致。LU等[25]研究了豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)抗哈维氏弧菌遗传力, 利用线性和阈值模型估算的遗传力范围为0.16~0.24, 属中低遗传力水平。瞿诗雨等[26]采用4种模型对豹纹鳃棘抗哈维氏弧菌遗传参数进行分析, 得出的遗传力范围为0.182~0.486, 属于中等水平遗传力。李寅等[27]报道了不同日龄长牡蛎抗溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)的遗传力, 通过父母本阈值模型估计了长牡蛎家系存活性状的遗传力为0.25~0.41, 为中低等遗传力。曲旻等[28]使用单性状动物模型评估了凡纳滨对虾仔虾的耐高温性状遗产参数, 结果显示其遗传力为0.22±0.05, 为中等遗传力水平。王崇懿等[29]对凡纳滨对虾的生长与耐高盐性状进行了遗传力评估, 遗传力为0.032±0.031, 属于低遗传力。上述研究报道与本次研究的遗传力相似, 且均属于中低水平遗传力, 本研究采用模型CTM时分析了攻毒后不同时间点的遗传力, 结果显示, 随着攻毒时间的增长, 泥蚶死亡率上升, 抗性性状的遗传力逐渐升高, 死亡率接近50%时, 遗传力在0.11~0.17, 略小于实验终止时的遗传力0.18, 如果过早结束实验进行遗传力分析, 实验结果可能会出现偏差。ØDEGÅRD等[30]认为当累计死亡率约为50%或者当死亡率自然达到0时, 可以选择停止实验, 增加遗传预测的准确性。群体选育的方式适合抗性性状遗传力较高时选择, 家系选育的方式则在抗性性状遗传力较低时选择较为合适, 泥蚶对哈维氏弧菌的遗传力为中低水平, 适宜通过家系选育进行改良。
3.3 生长与抗性性状的遗传相关性为了探究生长性状对弧菌抗性性状之间的影响, 避免育种决策中产生单性状选择导致的不良后果, 本研究全面估算了4个生长性状与抗性性状之间的遗传相关性。分析表明, 泥蚶家系的壳长、壳高、壳宽和体质量与抗性性状的表型相关和遗传相关均为中低度负相关, 结果未检测到相关性。LI等[31]研究了半滑舌鳎对迟缓爱德华氏菌的抗性, 发现生长性状与抗性性状的表型和遗传相关性均较低, 且没有显著性差异, 认为生长性状的遗传改良不太可能对迟缓爱德华氏菌的抗病性有任何实质性影响。LIANG等[32]对文蛤副溶血弧菌抗性性状的遗传相关性进行研究, 结果表明, 不同家系的生长性状与抗性性状的表型相关均不显著, 遗传相关为不显著的低正相关, 说明生长与抗弧菌性是两个相对独立的性状, 选育时可以分别进行选育。FLORES-MARA等[33]发现虹鳟(Rainbow trout)对传染性胰腺坏死的抗性与收获体质量的相关性不显著。此外, 生长性状与抗性性状之间的遗传正相关有很多报道, 如NIELSEN等[34]报道了鲤鱼(Cyprinus carpio)的体长和体质量与存活率之间存在显著的遗传正相关。SHI等[35]研究得出凡纳滨对虾生长与抗逆性状的遗传相关和表型相关均呈显著的正相关。在对半滑舌鳎的研究当中, LI等[36]用其对哈维氏弧菌抗性研究遗传相关性为中度遗传相关, 而对迟缓爱德华氏菌抗病性的遗传相关不显著, 同一物种不同的病原体估算出的遗传相关就有可能不同, 而不能一概而论。与上述研究结果相反, YÁÑEZ等[37]的研究发现大西洋鲑鱼(Salmo salar)对鱼立克次氏体的抗性与体质量之间是遗传负相关。CHI等[38]报道称长牡蛎幼虫和稚贝期的生长性状与存活率之间具有低遗传相关性。通过以上研究可以发现, 不同物种的生长性状与抗性性状之间的遗传相关和表型相关并不是有规律的, 需要根据具体情况评估选育物种不同性状之间的遗传相关性进行选育。在本研究中, 两性状间的遗传和表型相关均呈不显著的遗传负相关, 表明生长性状和抗性性状在育种中可分别进行选育。
4 结论本研究通过对22个泥蚶家系进行哈维氏弧菌的感染实验, 利用3种遗传评定模型评估了泥蚶抗哈维氏弧菌的遗传力、育种值相关系数以及表型和遗传相关。分析出该性状的遗传力范围为0.18~0.20, 属中低遗传力水平, 适宜通过家系选育的方式进行改良。3种模型间的育种值的相关系数均>0.95, 呈现极显著的正相关, 说明3种模型对抗性性状遗传参数的估算能力相近。此外, 两性状间的表型和遗传相关均呈不显著的负相关, 表明生长性状和抗性性状在育种中可分别选育。该研究补充了泥蚶抗哈维氏弧菌遗传参数估计的相关内容, 为泥蚶优良品系的选育提供基础资料和科学依据。
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