海洋与湖沼  2015, Vol. 46 Issue (5): 1228-1234   PDF    
http://dx.doi.org/10.11693/hyhz20150300072
中国海洋湖沼学会主办。
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文章信息

方卫东, 唐旭, 刘源森, 林凌, 黄仕新, 高培丽, 徐长安. 2015.
FANG Wei-Dong, TANG Xu, LIU Yuan-Sen, LIN Ling, HUANG Shi-Xin, GAO Pei-Li, XU Chang-An. 2015.
一株海洋生境芽孢杆菌FA08的筛选、鉴定及其酶学特性和抗菌性能分析
SCREENING AND IDENTIFICATION, ENZYME CHARACTERISTICS, AND ANTIBACTERIAL ACTIVITY OF A MARINE BACILLUS STRAIN FA08
海洋与湖沼, 46(5): 1228-1234
Oceanologia et Limnologia Sinica, 46(5): 1228-1234.
http://dx.doi.org/10.11693/hyhz20150300072

文章历史

收稿日期: 2015-03-10
收修改稿日期: 2015-04-26
一株海洋生境芽孢杆菌FA08的筛选、鉴定及其酶学特性和抗菌性能分析
方卫东1,2, 唐旭3, 刘源森3, 林凌3, 黄仕新3, 高培丽3, 徐长安3     
1. 集美大学水产学院 厦门 361021;
2. 福建省海新集团有限公司 漳州 363102;
3. 国家海洋局第三海洋研究所 厦门 361005
摘要:利用生防细菌拮抗病原菌,是水产疾病防治的有效措施之一。本研究从福建省宁德市海水养殖区底泥筛选到一株既能产纤维素酶又具有拮抗水产病原菌功能的芽孢杆菌FA08,通过传统的形态学、生理生化鉴定手段,并结合16S rDNA序列分析,鉴定功能菌FA08为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis, GenBank登录号:KM892857)。进一步考察功能菌FA08菌株所产的纤维素酶对pH值、温度和紫外线的敏感性发现,功能菌FA08所产纤维素酶对酸碱度具有很强的耐受力, pH 3至pH 10范围内保持稳定,对温度也有较好的稳定性,在30-80℃范围内,其酶活仍达到70%,对紫外线不敏感。对FA08的抗菌性能进行分析,结果发现,功能菌FA08发酵上清对嗜水气单胞菌、哈维氏弧菌、溶藻弧菌、副溶血弧菌及金黄色葡萄球菌有拮抗效果。因此,该菌对未来水产业具有良好的开发应用价值。
关键词地衣芽孢杆菌     纤维素酶     筛选鉴定     酶活特性     抗菌活性    
SCREENING AND IDENTIFICATION, ENZYME CHARACTERISTICS, AND ANTIBACTERIAL ACTIVITY OF A MARINE BACILLUS STRAIN FA08
FANG Wei-Dong1,2, TANG Xu3, LIU Yuan-Sen3, LIN Ling3, HUANG Shi-Xin3, GAO Pei-Li3, XU Chang-An3     
1. Fisheries College, Jimei University, Xiamen 361021, China;
2. Fujian Provincial Haixin Group Co., Ltd., Zhangzhou 363102, China;
3. Third Institute of Oceanography, State Oceanic Administration, Xiamen 361005, China
Abstract:To develop biocontrol technology with bacterium against pathogens for prevention from aquatic diseases, we screened a bacillus strain FA08 from mud in an aquaculture area in Ningde, Fujian, China. The strain could produce with cellulase and showed antimicrobial activity, and has been identified as Bacillus licheniformis(GenBank Accession number KM892857), based on its 16S rDNA sequence homology, together with the morphological, physiological and biochemical characteristics. Analysis of its enzyme characteristic showed that the cellulase could stand in a wide pH range from 3 to 10 and remain thermally stable in 30-80℃ with relative cellulase activity up to 70%. Moreover, the cellulase was insensitive to UV. In addition, we tested the antimicrobial activity of FA08 against selected aquatic pathogens. The results revealed that supernatant of the strain could inhibit strongly against Aeromonas hydrophila, Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio parahaemolyticus, and Staphylococcus aureus. Therefore, strain FA08 and its cellulase product shall have promising values of development and application for aquaculture.
Key words: Bacillus licheniformis     cellulase     screening and identification     enzymatic character     antimicrobial activity    

随着健康养殖业的发展,有益微生物的应用越来越广泛,如在水产养殖过程中,使用光合细菌、枯草芽孢杆菌等微生物制剂改善养殖环境,降低疾病的发生,取得了较好的效果(Vanittanakom et al,1986; Burgess et al,1993; Barsby et al,2001; Vaseeharan et al,2003; 顾继锐等,2011; 张庆华等,2011; 高存川等,2012; 潘娟等,2012; 张峰峰等,2012); 通过筛选生防细菌,利用生防细菌对水产病原菌的抑制作用,寻找替代抗生素的新途径,如从高度污染的海滩污泥中,分离得到一株枯草芽孢杆菌LHB02对三种弧菌包括哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)、溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)和鳗弧菌(Vibrio anguillarum)都有很强的抑制作用(徐长安等,2011); 从不同生长阶段的对虾肠道中分离对病原菌(鳗弧菌、副溶血弧菌、哈维氏弧菌)有拮抗作用的细菌(李海兵等,2008)。另外专家学者也开展了利用益生菌、酶制剂促进水产养殖动物的健康和提高饲料利用率方面的研究(Tamehiro et al,2002; Liu et al,2010),并取得了很好的试验效果,如芽孢杆菌、低聚木糖、复合酶制剂及它们的配伍物可以促进异育银鲫的生长,提高饲料利用率,促进肠道有益微生物的生长和抑制有害微生物,并且能提高肝胰脏蛋白酶mRNA表达量和肠道酶活性(刘文斌等,2007); 在饲料中添加粪肠球菌能够促进罗非鱼生长,提高饲料利用率,降低血清胆固醇和甘油三酯含量以及谷丙转氨酶活性,同时增加肠道乳酸菌数量,改善肠道微环境(周晓波等,2014); 纤维素酶可降低动物胃肠内容物的粘稠度,促进内源酶的扩散,提高养分的消化吸收(胡喜峰等,2004); 饲料中添加纤维素酶,草鱼增重率提高,饵料系数降低,干物质、粗蛋白、粗脂肪和粗纤维消化率都提高,体成分没有显著变化(高春生等,2006)。

目前,同时具有产酶和抗菌性能的功能菌株筛选报道较少,本实验室在前期的功能菌筛选中,筛选到一株既产纤维素酶又具有拮抗水产病原菌的芽孢杆菌,本研究报道了该功能菌的筛选、鉴定,及对功能菌产生的纤维素酶进行耐温、耐酸碱和对紫外线的稳定性进行考察,并开展功能菌对水产常见病原菌的拮抗效果分析,初步评估该功能菌株的价值,为以后开发该菌株提供依据。

1 材料与方法 1.1 样品来源

用于筛菌的样品采自福建省宁德市养殖池底泥。

1.2 培养基

LB培养基: 蛋白胨10g,酵母提取物5g,氯化钠 10g,水1000 mL,pH 7.2—7.4。

SLB培养基: 蛋白胨10g,酵母提取物5g,氯化钠 10g,琼脂20g,水1000 mL,pH 7.2—7.4。

产纤维素酶培养基: 蛋白胨 9.0 g、酵母膏 10.0 g,羧甲基纤维素钠 5.0 g,水1000 mL。

CMC-Na平板: 羧甲基纤维素钠15.0 g、硫酸铵1.0 g、酵母膏1.0 g、硫酸镁1.0 g、磷酸二氢钾1.0 g、琼脂20.0 g、水1000 mL,pH为自然值。

1.3 测试菌

嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila),爱德华氏菌(Edwardsiella),哈维氏弧菌(Vibrio harveyi),溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus),副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus),金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。

1.4 仪器设备

常规玻璃器皿、电子天平、超净工作台、打孔器、移液枪、台式摇床、高压蒸汽灭菌锅、恒温培养箱,PCR仪,核酸电泳仪,凝胶成像仪,多功能酶标仪和手提式紫外反射仪等。

1.5 功能菌的筛选 1.5.1 目标菌的分离

取10g污泥样品,加入100mL 0.85% NaCl中,搅拌后取上层浊液置于LB培养基,37°C,180 r/min,富集培养30h后,菌液置于75°C水浴20min。水浴后的菌液进行梯度稀释及平板涂布法进行分离。

1.5.2 功能菌产纤维素酶检测

分别挑取初筛得到的目标菌,标示为: FA01、FA02、FA03、FA04、FA05、FA06、FA07、FA08、FA09、FA10等以此类推,将这些目标菌置于LB培养基中,37°C,180 r/min,活化6 h,活化好的菌液按10%接种至产纤维素酶培养基,37°C,180 r/min,发酵48h 后,10000 r/min,离心6min,弃去沉淀,得上清液,为粗酶液; 采用CMC-Na平板,打孔后,孔内添加50μL所得的上清液,之后置于37°C过夜; 反应后的平板用刚果红染色1h,接着用0.85% NaCl脱色,观察是否出现水解圈,出现水解圈的即定为功能菌。每株菌做三个重复。

1.6 功能菌的鉴定

参照《常见细菌系统鉴定手册》(东秀珠等,2001)进行功能菌生物学特征观察和生理生化试验,并结合16S rDNA序列分析方法进行鉴定。

1.6.1 生物学特征观察

将功能菌接种至SLB培养基的培养皿平板,放入温度设置为37°C的恒温箱中,培养24 h,观察菌落形态特征。

1.6.2 生理生化试验

进行功能菌部分生理生化试验,包括D-葡萄糖、L-阿拉伯糖、D-木糖、D-甘露醇的产酸试验; 接触酶、苯丙氨酸脱氨酶试验、明胶、淀粉、酪氨酸水解试验; V-P测定、吲哚产生试验、利用柠檬酸盐试验。

1.6.3 16S rDNA序列分析

参照文献(徐长安等,2011),采用磁珠法基因组DNA抽提试剂盒提取功能菌全基因组。以全DNA为模板,使用细菌16S rDNA通用引物,27F: 5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’和1492R: 5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’。用Taq DNA聚合酶进行PCR扩增,PCR程序为: 94°C预变性4min; 94°C 45s,55°C 45s,72°C 1 min,30个循环; 72°C 10 min修复延伸; 4°C ∞终止反应。使用SanPreP柱式DNA胶回收试剂盒纯化PCR产物。纯化后的PCR产物送至上海生工测序。将测得的16S rDNA序列输入www.ncbi.nlm.nih.gov Blast进行同源性搜索,选取其中与之同源性较高的菌株,用MEGA软件进行系统发育树分析,构建进化树。

1.7 酶活特性分析

接种功能菌株至LB培养基中,37°C,180 r/min,活化6h,活化好的菌液按10% 接种至产纤维素酶培养基,37°C,180 r/min,发酵24h后,10000 r/min,离心6min,弃去沉淀,得上清液,为粗酶液。参照文献(韩铭等,2012; 于岚等,2013),采用3,5-二硝基水杨酸比色定糖法(DNS)进行酶活测定,分别考察功能菌株所产的纤维素酶对温度、pH值和紫外线的耐受能力。

1.7.1 酶对pH值的耐受能力检测

粗酶液在不同pH缓冲液(3.0,4.0,5.0,6.0,7.0,8.0,9.0,10.0)混合均匀,置于37°C,处理1h,测定残存酶活,以最高酶活为100%。

1.7.2 酶对温度的耐受能力检测

粗酶液分别在温度为 30、40、50、60、70、80°C的水浴锅中处理1h后,测定残存酶活,以最高酶活为100%。

1.7.3 紫外线对酶活性的影响

粗酶液分别在紫外线波长365nm,距离10cm下照射10、20、30、40、50、60 min后,测定残存酶活,以最高酶活为100%。

1.8 拮抗性能检测 1.8.1 抑菌板的制作

选择嗜水气单胞菌、爱德华氏菌、哈维氏弧菌、溶藻弧菌、副溶血弧菌、金黄色葡萄球菌,用接种环刮下菌体接种至装有5mL LB培养基的试管中,放入温度设置为37°C,转速为180 r/min的摇床中培养16h后,取1 mL的培养液至100 mL的45—50°C的SLB培养基中,迅速摇匀倒板,待凝固后用打孔器打孔。

1.8.2 发酵上清的制备

功能菌FA08斜面接种至装有5mL LB培养基的试管中,放入温度设置为37°C,转速为180 r/min的摇床中活化6 h后,按10%的接种量至装有50 mL LB培养基的三角瓶中,放入温度设置为37°C,转速为180 r/min的摇床中发酵17 h,10000 r/min 离心6 min,得发酵上清。

1.8.3 采用琼脂扩散法(agar diffusion method)进行测定(Tagg et al,1971)。通过测量圆形的透明带(抑菌圈)直径的大小来表示发酵上清液抑菌活性的强弱 2 结果与分析 2.1 目标菌筛选结果

经实验发现,标识为FA08的菌株,三个重复均出现水解圈,如图 1所示,而其它菌株未出现水解圈,因此 FA08为目标功能菌。

图 1 功能菌FA08水解圈 Fig. 1 The hydrolysis circle of strain FA08
2.2 功能菌FA08生物学特征观察

将功能菌FA08接种至SLB培养基的培养皿平板,37°C培养24h,发现菌落白色微黄,中间凸起,表面光滑,边缘不规则,革兰氏染色为阳性,产芽孢。

2.3 生理生化试验

功能菌FA08的部分生理生化实验结果如表 1所示。

表 1 功能菌FA08的生理生化检测结果 Tab.1 Physiological and biochemical characteristics of strain FA08
试验项目 结果
D-葡萄糖 +
L-阿拉伯糖 +
D-木糖 +
D-甘露糖 +
接触酶 +
苯丙氨酸脱氨酶 -
明胶水解 +
淀粉水解 +
酪氨酸水解 -
V-P测定 +
吲哚试验 -
利用柠檬酸盐 +
“+”为阳性, “-”为阴性
2.4 16S rDNA鉴定结果

16S rDNA测序结果显示,菌株FA08的16S rDNA序列全长为1407bp。全序列见图 2。将测得的序列输入国际核酸数据库(http: //www.ncbi.nlm.nih. gov),用Blast进行同源序列搜索,在搜索结果中,选出同源性较高的菌株系列(表 2),用MEGA 软件进行系统发育分析,并构建系统进化树,结果如图 3所示,通过比较可以明显看出,FA08在遗传位置上与Bacillus licheniformis(X68416)和Bacillus licheniformis(NR118959)两株地衣芽孢杆菌最近,且与Bacillus licheniformis(X68416)同源性最高达99%。结合其形态学及生理、生化特征,鉴定功能菌 FA08为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis),登录号为KM892857。

图 2 功能菌FA08 16S rDNA 测序结果 Fig. 2 The 16S rDNA sequence of strain FA08
图 3 基于16S rDNA序列的系统发育树 Fig. 3 Phylogenetic dendrogram based on 16S rDNA sequence
表 2 选自基因库中用于构建系统发育树的菌株及其录入号 Tab.2 The strains and the accession numbers in GenBank for phylogenetic dendrogram construction
基因库录入编号 菌株名称
X68416 Bacillus licheniformis
NR118959 Bacillus licheniformis
X60633 Bacillus popilliae
NR115933 Bacillus coahuilensis
NR044086 Virgibacillus chiguensis
NR042744 Virgibacillus kekensis
X82436 Gracilibacillus dipsosauri
NR118442 Bacillus aryabhattai
NR108949 Bacillus xiaoxiensis
NR112165 Paenibacillus macquariensis
NR114457 Paenibacillus lentimorbus
NR109383 Pelosinus propionicus
NR 109390 Pelosinus fermentans
FJ655812 Bacillus amyloliquefaciens
2.5 酶学特性分析结果 2.5.1 pH值对FA08所产生的纤维素酶稳定性的影响

图 4所示,FA08所产纤维素酶在pH 4下稳定性最好,且pH 3和pH 5—10下保持较好的稳定性,相对酶活保持在85%以上,因此该酶对酸碱的耐受能力较强。

图 4 pH值对FA08所产生的纤维素酶稳定性的影响 Fig. 4 The effect of pH on the stability of cellulase produced by strain FA08
2.5.2 温度对FA08所产生的纤维素酶稳定性的影响

图 5所示,FA08所产纤维素酶在30—40°C保持较好的稳定性,50—70°C相对酶活保持在75%以上,80°C下相对酶活仍能保持在70%以上,因此该酶对温度具有较好的耐受能力。

图 5 温度对FA08所产生的纤维素酶稳定性的影响 Fig. 5 The effect of temperature on the stability of cellulase produced by strain FA08
2.5.3 紫外线对FA08所产生的纤维素酶稳定性的影响

图 6可以看出在紫外线照射的条件下FA08所产生的纤维素酶保持稳定性,酶活均接近100%,因此该纤维素酶对紫外线具有很强的耐受性。

图 6 紫外线对FA08所产生的纤维素酶稳定性的影响 Fig. 6 The effect of UV on the stability of cellulase produced by strain FA08
2.6 功能菌FA08发酵上清对水产病原菌的拮抗性能

拮抗试验结果表明: 如表 3所示,功能菌 FA08 对水产养殖常见致病菌: 嗜水气单胞菌哈维氏弧菌、溶藻弧菌、副溶血弧菌和金黄色葡萄球菌均有较强的抑制作用,其中对嗜水气单胞菌抑制作用最强。

表 3 功能菌FA08发酵上清对病原菌的拮抗性能 Tab.3 Antimicrobial activity of FA08’s supernatant on selected pathogens
病原菌 抑菌圈直径(mm)
嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila) 20.54±0.34
爱德华氏菌(Edwardsiella) 10.31±0.25
哈维氏弧菌(Vibrio harveyi) 18.12±0.46
溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus) 17.16±0.18
副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) 17.46±0.22
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus) 17.95±0.31
3 讨论

地衣芽孢杆菌作为生防细菌广泛应用于植物病害防治、饲料加工、医药开发、环境污染治理等方面(唐娟等,2008)。1989年,美国FDA和美国饲料控制官员协会公布了地衣芽孢杆菌是安全的微生物物种,可以直接饲用; 我国农业部也把地衣芽孢杆菌列入饲料添加剂目录(马鑫等,2011),允许在饲料中直接添加。另外,地衣芽孢杆菌在水产养殖方面也有很好的应用价值,如地衣芽孢杆菌作为鱼饲料添加剂,不仅可以促进鱼体生长,而且益于养殖水体的保护(葛文霞等,2014); 地衣芽孢杆菌和低聚木糖,可提高鱼体中消化酶的活性,有助于维持肠道内的微生态平衡,促进动物生长(刘波等,2006); 地衣芽孢杆菌增加了肠道消化酶活性,促进了鱼体生长(刘波等,2005)。另有研究表明,地衣芽孢杆菌具有耐高温、耐酸碱的特性,并能产生蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶和纤维素酶等,有助于降解植物性饲料中某些复杂的碳水化合物,消除抗营养因子(董尚智等,2009)。本实验所筛选的功能菌FA08鉴定为地衣芽孢杆菌,且可产生纤维素酶,预示着该菌具有较好的开发与应用前景。

通过考察地衣芽孢杆菌FA08产生的纤维素酶对酸碱稳定性的影响,发现FA08产生的纤维素酶对酸碱均能保持较好的稳定性,pH3和pH 5—10下相对酶活保持在85%以上,与杨丽娜等(2012)筛选到的芽孢杆菌属(Bacillus)微生物所产的纤维素酶相比,在酸性条件下的耐受能力强,具有相似性,而在中性、碱性条件下地衣芽孢杆菌FA08产生的纤维素酶更具耐受能力。水产动物大多数无胃,消化道呈中性(鲤科鱼类)或偏碱性(王仁华等,2011),因此地衣芽孢杆菌FA08产生的纤维素酶不仅适合于有胃的动物,而且也适合应用于水产动物。另外,地衣芽孢杆菌生长条件要求低,繁殖快,能迅速定植在肠黏膜上,在短时间内成为肠道的优势菌群(张菊等,2012),并在肠道中发挥作用,有利于开发成为内服的微生物制剂。

实验发现,地衣芽孢杆菌FA08产生的纤维素酶对温度有较好的耐受能力,耐受80°C下相对酶活仍能保持在70%以上,与葛春辉(2009)筛选到的蜡质芽孢杆菌所产的纤维素酶相比,更具有耐温特性。在饲料原料中,杂粕类的原料粗纤维含量高,存在抗营养因子,大大限制了其在饲料中的使用量,目前发酵技术的应用,可提高杂粕类原料的使用价值,降解杂粕原料中水产动物难以消化的纤维素,消除抗营养因子,提高杂粕原料的利用率。一般饲料原料的发酵温度可达60—80°C,而地衣芽孢杆菌FA08产生的纤维素酶可较好耐受发酵温度,可应用于杂粕的发酵,提高杂粕的营养价值。

地衣芽孢杆菌对有害微生物具有拮抗作用: 如地衣芽孢杆菌Wl0能产生抗菌蛋白,对多种植物病原菌有较好的抑制效果(纪兆林等,2013); 又如地衣芽孢杆菌c-4具有较广的抑菌范围,对番茄枯萎病菌、玉米弯孢叶斑病菌、胶孢炭疽病菌、棉花枯萎病菌、棉花黄萎病菌、小麦赤霉病菌和西瓜枯萎病菌等均有抑制作用(孙正祥等,2009)。然而地衣芽孢杆菌对水产养殖病原菌的拮抗特性报道较少。本实验也探讨了地衣芽孢杆菌FA08发酵上清对水产常见病原菌的拮抗效果,发现地衣芽孢杆菌FA08对水产病原菌: 嗜水气单胞菌爱德华氏菌、哈维氏弧菌、溶藻弧菌、副溶血弧菌和金黄色葡萄球菌均有较强的拮抗作用。由于地衣芽孢杆菌具有在水产动物肠道定植的特性,这意味着地衣芽孢杆菌FA08进入水产动物肠道后,在肠道内可产生拮抗物质,对病原菌进行抑制或杀灭作用,促进水产动物肠道健康,有着重要的意义,另外,也可利用FA08的拮抗性能,制备微生物杀菌剂。

本研究开展了地衣芽孢杆菌FA08的筛选与鉴定,考察了该菌的酶学性质和抗菌特性,初步评估该菌的开发与应用价值,下一步将进行其作为养殖动物肠道定植菌、杂粕饲料发酵菌及制备微生物杀菌剂的研究与开发,实现FA08在水产养殖中的应用价值。

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