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翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)EST-SSR标记与生长性状相关性及4个选育群体遗传结构研究*
袁文成,叶金明,黄鹤忠,肖攀,路瑶,李泽,朱传坤
作者单位E-mail
袁文成 苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州;扬州市水产生产技术指导站 扬州;苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 wencheng_bio@126.com 
叶金明 扬州市水产生产技术指导站 扬州 225007  
黄鹤忠 苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心 淮安 223300 suda_shuisz@163.com 
肖攀 苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心 淮安 223300  
路瑶 苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心 淮安 223300  
李泽 苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心 淮安 223300  
朱传坤 江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心 淮安 223300  
摘要:
采用翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组高通量测序并筛选得到的13对多态性EST-SSR引物,对60尾翘嘴鳜的体长、体高、体厚及体重4种生长性状进行标记-性状相关性研究,并对4个翘嘴鳜选育群体各30尾个体进行遗传结构分析。结果显示,与其生长性状显著相关的微卫星分子标记有5个,包括:分别与体厚和体长极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05)的标记C10127,AA型为体长、体厚的优势基因型,而AC型为劣势基因型;与体重显著相关(P<0.05)的标记C19016,AA型为体重的优势基因型,AB型为体长和体重的劣势基因型;分别与体长和体高、体厚、体重极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05)的标记C14847,BB型为体厚的优势基因型;分别与体长和体重极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05)的标记C12350,BC型为体长、体厚、体高和体重性状的优势基因型;分别与体厚、体重和体高极显著相关(P<0.01)和显著相关(P<0.05)的C18691标记,BB型为4种生长性状的优势基因型。4个翘嘴鳜群体遗传多样性高低依次为太湖选育群体>长江口选育群体>洪泽湖选育群体>鄱阳湖选育群体,其平均的等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为2.2115、1.9405、0.55513、0.5925和0.3775,属于中度多态水平。
关键词:  翘嘴鳜  EST-SSR标记  生长性状  遗传结构  相关性分析
DOI:10.11693/hyhz20171000257
分类号:
基金项目:江苏省科技计划重点项目, BE2017311号; 江苏省区域与环境保护协同创新项目, 48SKY00号; 苏州市科技计划农业应用基础研究项目, SNG201608号。
STUDY ON CORRELATION OF EST-SSR MARKERS WITH GROWTH TRAITS AND GENETIC STRUCTURE OF 4 BREEDING POPULATIONS IN MANDARIN FISH (SINIPERCA CHUATSI)
YuanWencheng,Ye Jinming,Huang Hezhong,XiaoPan,Lu Yao,Li Ze,Zhu Chuankun
Abstract:
The linkage between 4 kinds of growth traits Include body length, body height, body weight and thickness of 60 individuals and marker trait and genetic structure of 4 breeding groups each of 30 individuals of Mandarin fish Siniperca chuatsi had been analyzed by 13 polymorphic EST-SSR microsatellites obtained by transcriptome high-throughput sequencing and screening. The linkage analysis showed that: the locus C10127 had a extremely significant impact on body thickness (P<0.01) and a significant impact on body length (P<0.05) and AA at C10127 was favorable genotype for body length and thickness traits while AC was disadvantage genotype; locus C19016 showed a significant impact on body weight (P<0.05), in which AA was the dominant genotype of body weight while the AB was the negative genotype of body length and body weight; locus C14847 had a extremely significant impact on body length (P<0.01) and a significant impact on body height, body weight, thickness (P<0.05), among them allele BB was advantage genotype of thickness; locus C12350 had a extremely significant impact on body length (P<0.01) and a significant impact on body weight (P<0.05), in which BC was dominant genotype of this 4 kinds of growth traits; locus C18691 had a extremely significant impact on body weight, thickness (P<0.01) and a significant impact on body height (P<0.05), and BB was dominant genotype of this 4 kinds of growth traits. The genetic diversity analysis showed that the value of mean valid alleles was 1.9405, the number of mean expected heterozygosity was 0.5925 and the mean polymorphism information content was 0.3775.
Key words:  Siniperca chuatsi  EST-SSR marker  growth trait  genetic structure  correlation analysis
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