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中国卤虫(Artemia sinica)早期胚胎发育相关基因表达序列标签(ESTs)分析
侯林,邹向阳,姚锋,林盛国,徐明玉,陈志娟,姜丽娟,孙文静
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摘要:
以mRNA差异显示技术分析了中国两性生殖卤虫早期胚胎发育相关基因的表达序列标签(ESTs),共回收了2000条差异条带并进行了克隆、测序,在GenBank/DDBJ/EMBL数据库中用BLASTX和BLASTN软件分别与NCBI上的非冗余核酸序列数据库进行同源性比对,得到分值较高、长度在100bp-2kb以内的ESTs序列133条.所发现的133条ESTs的生物学功能分类为:能量代谢占24%、细胞生长、分裂相关基因占23%、RNA相关占17%、体节形成占12%、蛋白质合成占3%、转录因子占3%、离子转运占5%、细胞信号转导占4%、未知占9%.对所发现的ESTs进行了RT-PCR测定,排除假阳性能够提供足够数量的信息用于获取其全长cDNA,进而获得其全长基因序列以用于功能研究.另外,研究发现了包括小热休克蛋白基因家族、Hox基因家族的abdA和Dfd基因、A-trh基因(排盐器官及盐调节基因)、HIF(缺氧诱导因子)、CK-M2(肌肉型磷酸激酶基因)和GRP基因(富甘氨酸蛋白基因)等20个具有明显功能的相关基因的ESTs和完整基因序列和开放阅读框(ORF).经初步推断这些ESTs和基因的功能大多为与卤虫发育的生理、生化相关的基因有关.所研究的133条ESTs基本代表了卤虫早期胚胎发育相关功能基因的表达谱.
关键词:  中国卤虫  早期胚胎发育相关基因  表达序列标签
DOI：10.11693/hyhz20080222022
分类号:Q344.1
基金项目:国家自然科学基金
THE EXPRESSED SEQUENCE TAGS OF ARTEMIA SINICA GENE IN EARLY EMBRYOS DEVELOPMENT
HOU Lin  ZOU Xiang-Yang  Yao Feng  LIN Sheng-Guo  XU Ming-Yu  CHEN Zhi-Juan  JIANG Li-Juan  SUN Wen-Jing
Abstract:
Key words:  
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